IP实验步骤
一、样本制备
1、 细胞收集
1.1、贴壁培养细胞收集:去除贴壁细胞的培养液,用预冷PBS清洗细胞2次,吸出PBS。
1.2、悬浮培养细胞收集:先3000转/min 离心5分钟收集细胞沉淀,再用预冷PBS轻轻吹打重悬,离心收集细胞沉淀。
1.3、组织样本收集:用干净的医用剪剪碎目标组织,使组织块尽量小,此操作最好在冰上进行,并且应尽快完成,以防止样品被蛋白酶降解。将组织用液氮或超低温冰箱中冷冻30min,迅速用液氮研磨,研磨过程尽量控制在1~2min之内,以减少蛋白的降解。
2、总蛋白提取
2.1、细胞/组织裂解:对于细胞样本,加入预冷的RIPA裂解缓冲液(含有PMSF)(每107细胞/100 mm 培养皿/150cm2 培养瓶加入1ml;每5×106细胞/60mm 培养皿/75cm2培养瓶加 0.5ml),冰上裂解15min。
2.2、对于组织样本,按照1mL 裂解液/100mg组织向匀浆器中加入蛋白裂解液,多次匀浆,直至组织完全匀浆,收集匀浆液。(裂解液中根据需要选择添加或不添加蛋白酶抑制剂)。
2.3、离心:把裂解好的样本置于于预冷的高速冷冻离心机中,12000rpm,10min。
2.4、浓度测定:离心完成后,弃去沉淀,保存上清。吸取10μl蛋白上清做蛋白浓度测定。
建议:
(1)高浓度的去垢剂会干扰免疫沉淀效果。所以可先用小体积RIPA裂解细胞制备裂解物,在开始IP捕获前,再补加1 X PBS或孵育液稀释到需要的体积。
(2)使用足量的蛋白裂解物:单管IP实验,推荐裂解物初始体积为0.2–0.4ml, 含1–3 mg总蛋白。可采用Bradford 或BCA法测定总蛋白浓度。
(3)裂解液中加蛋白酶抑制剂,用量可以是正常WB实验制样的1.5-2倍。
3、裂解物预处理(可选)
3.1、45°角剪掉枪头末端,快速吸取重悬的Protein A sepharose beads悬液,加入含有裂解物的EP管中。通常1-3mg总蛋白裂解物需加入30μl重悬的Protein A sepharose beads悬液。
3.2、4℃旋转孵育60min(推荐用垂直旋转混合仪,低速旋转)。
3.3、4℃、500g 离心1min,将上清转入新的EP管中。
建议:对于富含IgG的组织,推荐裂解物预处理步骤。
二、免疫沉淀
1、吸取含有1-3mg总蛋白的裂解液(或预处理)0.2-0.4mL 加入EP管中,然后加入约4μg目标抗体。另取等量裂解物,加入等量同型IgG和等量孵育液孵育作为control IgG对照组。4℃旋转孵育2-4h或过夜。
2、然后加入50μl重悬的Protein A sepharose beads,4℃旋转孵育2-4h。
3、4℃、500g 离心30s,弃上清。
4、每次用1mL 1xTBST(现加蛋白酶抑制剂)洗涤沉淀复合物,4℃、500g 离心30s,弃上清。重复洗涤4次,最后一次离心结束后,EP管中保留80μl液体,其他弃去。
5、加入20μl 5x SDS Sample Buffer,重悬复合物,95℃加热变性5min。8000-10000g 离心3min, 小心吸取上清转入新的EP管中。
三、WB分析
1、将收集的IP样本进行SDS-PAGE电泳,剩下的IP样本保存在-80℃。
2、电泳后转膜,使用合适抗体进行后续分析。
四、二抗选择
IP捕获抗体 |
WB检测一抗 |
WB检测二抗 |
备注 |
小鼠来源 |
小鼠来源 |
HRP-protein A 或HRP-抗小鼠IgG |
WB一抗若为 mouse IgG1/IgG3 亚型,HRP-标记 Protein A亲和力较低,可适当降低其稀释度(也可先尝试HRP-抗小鼠IgG二抗);WB一抗若为小鼠 IgM/IgA 亚型,则避免选择 HRP- ProteinA,因其不结合。 |
兔来源 |
HRP-抗兔IgG |
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兔来源 |
小鼠来源 |
HRP-抗小鼠IgG |
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兔来源 |
HRP-protein A 或HRP-抗兔IgG轻链特异性抗体 |
HRP-Protein A可以有效降低重链信号以及消减轻链信号的影响,背景干净,适用于检测目的蛋白大小除45-55 |
注:孵育液配方
KCl |
0.2g |
KH2PO4 |
0.2g |
Na2HPO4·12H2O |
1.14g |
NaCl |
8g |
NaF |
0.42g |
EDTA.2Na.2H2O |
1.86g |
盐酸调pH至7.4,补ddH₂O定容至1000ml,4℃保存 |