文献解读 | IF=41.7,本研究开发了一种稳健的皮肤宏转录组学工作流程
皮肤微生物组通过影响宿主微环境、免疫稳态和健康发挥重要作用,但目前对其体内基因/通路活性的理解有限。宏基因组学仅能估算功能潜力,无法反映微生物在环境响应中的基因表达动态。例如,金黄色葡萄球菌和痤疮丙酸杆菌在某些情况下是无害定植菌,在另一些情况下却会加剧疾病,这种差异可能与基因表达和宿主-微生物互作有关。 皮肤宏转录组学研究受低微生物 biomass、宿主细胞污染和RNA稳定性低等问题制约。现有研究多依赖体外实验、动物模型或单一物种转录组学,缺乏对不同皮肤部位微生物基因表达的全面分析。虽然已有研究尝试用RNA测序描述痤疮中的微生物作用,但局限于单一物种且样本采集具有侵入性,难以应用于大规模临床研究。因此,开发一种稳健、非侵入性的皮肤宏转录组学方法,以揭示体内活性物种和微生物功能,对于深入理解皮肤微生物组在健康与疾病中的作用至关重要。